八百万の神々と共に、平和で穏やかな時を享受する世界・アスディバイン。
ところが、神を名乗る男・ハデスによって、
和の色彩に満ちた景色は、異物が混ざった不可思議な改変世界へと一変する。
精霊神・シキは、ハデスとの戦いの中で、
自らの力を「神之御玉（かみのみたま）」として世界中に分散させた。
再び正しい世界と歴史を取り戻すためには、各地の「神之御玉」を集めなくてはならない。

旅の途中で出会う、物静かな女の子と自由気ままで可愛らしい3人の女性たちと力を合わせ、
絆を深め、時に葛藤しながらも、道を切り開いていくシキ。
彼らがどのような結末へと辿り着くのかは『神』のみぞ知る――！？